后来到了后几代皇帝的时候，内阁阁员也只有私下给皇帝出主意，代皇帝批阅奏章而已。顶点m.23us.更新最快直到明英宗时期，他准许太监王振建立司礼监代皇帝批红，他把批阅和审核奏章的权力交给了内阁阁员。也就是说当时文人组成的内阁阁员和太监组成的司礼监成为了皇帝的左右人，一个管出主意，一个管批准不批准。除了一些大事情要上报之外，一般的军国大事就由内阁和司礼监处理了。从此内阁渐渐走上政治舞台，渐渐代替六部成为了中央政府最核心的衙门。自此内阁阁员成为了没有名义的宰相，成为了不是宰相的宰相。
到了嘉靖皇帝中后期，内阁的权利到达了顶峰。嘉靖皇帝号称二十年不上朝，除了偶尔个别会见几个内阁阁员之外，一般的大臣几乎不认识嘉靖皇帝本人。所有的国家大事都交给内阁阁员和司礼监负责不说，其实权力掌握在内阁首辅严嵩和司礼监掌印太监吕芳两个人手里。所以大家管严嵩这个内阁首辅称之为外相，吕芳这个司礼监掌印太监为相。文武百官以严嵩马首是瞻，锦衣卫东厂和司礼监等部门只听吕芳一个人的话。百官称严嵩为严相，大半的官员都是严嵩的弟子或者弟子的弟子，在严嵩面前行弟子礼。锦衣卫和东厂的人，跟着太监们一起称呼吕芳为老祖宗，真的把吕芳当做自己的祖宗一样供着敬着。
但是嘉靖皇帝不是傻子，他也防备着严嵩和吕芳。严嵩虽然控制着朝局，但是不是所有的人都愿意屈从于严嵩。嘉靖皇帝就把徐阶等几个和严嵩不对路的人保护起来。有意无意地壮大徐阶的力量，最后把徐阶安排进了内阁，让徐阶和严嵩内斗不止。只有这些人内部不团结，皇帝的位置才会太平。对于吕芳这个奴才更加简单了，吕芳再怎么样也只不过是一个太监，太监的一切都是主子给的。皇帝作为太监的主子，他可以给奴才一切，也可以收回一切。嘉靖皇帝利用陈洪牵制吕芳，必要的时候直接把吕芳换了，导师胡吕芳就什么也没有了。
按照内阁的传统，内阁有正式成员三到四名，统称为内阁阁员。但是因为分工和排名有先后，所以等级和权利也有区别。第一名为内阁首辅，是真正的一把手，是真正的宰相，百官之首。负责全面管理军国大事，分管吏部，负责官员的调动和升迁。相当于现在的国务院总理兼全国组织部部长；排名第二的是内阁次辅，分管军队和兵部，有时候也分管刑部或者工部。相当现在的国务院常务副总理兼国防部长兼政法委书记；第三名是内阁三辅，一般分管户部和全国税收，管国家的财务问题。相当于现在的国务院副总
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